Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Sgo1Q9CXH7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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