Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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