Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rpusd4Q9CWX4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rpusd4Q9CWX4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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