Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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