Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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