Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms