Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PompQ9CQT5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms