Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms