Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Atp6v0e1Q9CQD8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Atp6v0e1Q9CQD8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Atp6v0e1Q9CQD8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Atp6v0e1Q9CQD8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Atp6v0e1Q9CQD8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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