Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms