Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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