Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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