Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pole4Q9CQ36 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms