Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms