Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cep41Q99NF3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cep41Q99NF3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms