Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NsmfQ99NF2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms