Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Atoh8Q99NA2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Atoh8Q99NA2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Atoh8Q99NA2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Atoh8Q99NA2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Atoh8Q99NA2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atoh8Q99NA2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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