Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms