Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp1b4Q99ME6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms