Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms