Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1aQ99L02 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms