Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TrabdQ99JY4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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TrabdQ99JY4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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TrabdQ99JY4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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TrabdQ99JY4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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