Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms