Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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