Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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