Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms