Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Krt79Q8VED5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Krt79Q8VED5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Krt79Q8VED5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Krt79Q8VED5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt79Q8VED5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Krt79Q8VED5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Krt79Q8VED5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms