Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgtbQ8VD33 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms