Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms