Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnajc28Q8VCE1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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