Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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