Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms