Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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