Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms