Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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