Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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