Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rbm28Q8CGC6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rbm28Q8CGC6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rbm28Q8CGC6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rbm28Q8CGC6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rbm28Q8CGC6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rbm28Q8CGC6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rbm28Q8CGC6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm28Q8CGC6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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