Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc3Q8CFZ4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms