Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ercc8Q8CFD5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ercc8Q8CFD5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ercc8Q8CFD5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ercc8Q8CFD5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ercc8Q8CFD5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms