Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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