Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc38Q8CDN8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc38Q8CDN8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc38Q8CDN8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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