Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms