Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms