Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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