Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rapgef5Q8C0Q9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms