Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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