Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms