Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Me3Q8BMF3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms