Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms