Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atg4dQ8BGV9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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